Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtcP11725 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtcP11725 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms