Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
DmdP11531 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
DmdP11531 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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DmdP11531 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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DmdP11531 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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DmdP11531 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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DmdP11531 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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DmdP11531 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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DmdP11531 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
DmdP11531 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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