Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbcP0CG50 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbcP0CG50 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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