Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hbb-bh1P04444 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms