Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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