Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl20O89093 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms