Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CcnkO88874 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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