Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hps1O08983 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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