Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm20795J3QP49 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Gm20795J3QP49 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Gm20795J3QP49 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Gm20795J3QP49 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Gm20795J3QP49 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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