Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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