Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm3727J3QM54 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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