Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm21818J3KMS6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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