Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms