Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScaperF8VQ70 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms