Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9yF8VPU6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9yF8VPU6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9yF8VPU6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9yF8VPU6 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms