Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms