Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo5cE9Q1F5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms