Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc8E9PWG2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms