Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3298E9PW80 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3298E9PW80 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3298E9PW80 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3298E9PW80 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3298E9PW80 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3298E9PW80 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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