Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms