Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3543D3Z235 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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