Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms