Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samd1D3YXK1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms