Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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