Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Phf11bB4XVQ1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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