Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf11cB4XVP9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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