Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms