Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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