Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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