Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm6880A3KG45 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6880A3KG45 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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