Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp8b5A3FIN4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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