Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Samt1A2BED8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms