Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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