Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms