Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms