Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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