Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc194A0A140LIT1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms