Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Csmd2V9GX34 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Csmd2V9GX34 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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