Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krt27Q9Z320 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Krt27Q9Z320 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt27Q9Z320 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Krt27Q9Z320 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms