Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms