Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl8Q9Z121 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl8Q9Z121 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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