Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam50bQ9WTJ8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms