Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psma4Q9R1P0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psma4Q9R1P0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms