Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Fhl3Q9R059 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms