Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rad18Q9QXK2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rad18Q9QXK2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rad18Q9QXK2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rad18Q9QXK2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rad18Q9QXK2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rad18Q9QXK2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms