Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF1

Gabrq, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrqQ9JLF1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
GabrqQ9JLF1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GabrqQ9JLF1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms