Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TefQ9JLC6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms