Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Scamp5Q9JKD3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Scamp5Q9JKD3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms