Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ap3m1Q9JKC8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms