Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms